विश्वविद्यालय में कुलपति का पद 10 सितंबर से खाली है, जब पूर्व कुलपति सुहास पेडनेकर का कार्यकाल समाप्त हुआ था। प्रो-वाइस-चांसलर के रूप में कुलकर्णी का कार्यकाल भी उसी समय समाप्त हो गया था, क्योंकि पद सह-टर्मिनस हैं। तब से यह पद खाली पड़ा है और अतिरिक्त प्रभार कोल्हापुर विश्वविद्यालय के कुलपति डीटी शिर्के को दिया गया था।
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